MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii 1656-2 plasmid ABKp1

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017163	ATT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017163	TAAT	2	8	43	50	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017163	TCAA	2	8	124	131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017163	GT	3	6	182	187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017163	AAT	2	6	211	216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017163	CGGGC	2	10	251	260	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017163	T	7	7	366	372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017163	GCA	2	6	411	416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017163	TTA	2	6	508	513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017163	CTT	2	6	543	548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017163	GTC	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017163	TGAC	2	8	576	583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017163	AGG	2	6	610	615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017163	TCA	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017163	A	6	6	684	689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017163	AT	3	6	698	703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017163	T	6	6	705	710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017163	TAA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017163	GTA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017163	ATAAAG	2	12	1305	1316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017163	TTAA	2	8	1329	1336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017163	A	6	6	1343	1348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017163	TTA	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017163	ACT	2	6	1668	1673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017163	ATC	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017163	TTTAT	2	10	2427	2436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017163	GTTT	2	8	2491	2498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017163	TAA	2	6	2508	2513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017163	AT	3	6	3173	3178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017163	AAT	2	6	4176	4181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017163	T	7	7	4187	4193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017163	A	6	6	4194	4199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017163	TAA	2	6	4238	4243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017163	AAAGCA	2	12	4690	4701	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017163	TC	3	6	5548	5553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017163	A	6	6	5775	5780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017163	TATC	2	8	5791	5798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017163	CTAT	2	8	5850	5857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017163	T	9	9	5998	6006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017163	CGGGC	2	10	6030	6039	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017163	T	7	7	6145	6151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017163	GCA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017163	TTA	2	6	6287	6292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017163	CTT	2	6	6322	6327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017163	GTC	2	6	6330	6335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017163	TGAC	2	8	6355	6362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017163	AGG	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017163	TCA	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017163	A	6	6	6463	6468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017163	AT	3	6	6477	6482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017163	T	6	6	6484	6489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017163	TAA	2	6	6492	6497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017163	TA	3	6	6551	6556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017163	A	8	8	7441	7448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017163	T	7	7	7464	7470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017163	CAA	2	6	7490	7495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017163	AT	3	6	7497	7502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017163	ATTT	2	8	7509	7516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017163	T	6	6	7542	7547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017163	A	8	8	7869	7876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017163	T	7	7	7892	7898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017163	A	6	6	7914	7919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017163	T	6	6	7970	7975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017163	T	8	8	8568	8575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017163	TAA	2	6	8580	8585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017163	AAT	2	6	8628	8633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017163	ATA	2	6	8637	8642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017163	ACG	2	6	8654	8659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017163	ATTT	2	8	9257	9264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017163	ACG	2	6	9300	9305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017163	TGGT	2	8	9311	9318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017163	TA	4	8	9329	9336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017163	TCG	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017163	A	6	6	9508	9513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017163	A	8	8	9578	9585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017163	AAG	2	6	9598	9603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017163	GAC	2	6	9608	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017163	A	6	6	9685	9690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017163	CAAA	2	8	10120	10127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017163	CTT	2	6	10129	10134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017163	T	6	6	10185	10190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017163	A	7	7	10191	10197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017163	GATT	2	8	10203	10210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017163	ATG	2	6	10213	10218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017163	T	8	8	10235	10242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017163	CA	3	6	10245	10250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017163	TTA	2	6	10360	10365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017163	AT	3	6	10366	10371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017163	AAATAG	2	12	10372	10383	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017163	TTTA	2	8	10398	10405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017163	ATA	2	6	10453	10458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017163	TA	3	6	10457	10462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017163	TTTAT	2	10	10476	10485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017163	AT	3	6	10519	10524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017163	AAATAT	2	12	10561	10572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017163	TAT	2	6	16601	16606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017163	ATTAA	2	10	16638	16647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017163	GGTAAA	2	12	16664	16675	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017163	TATT	2	8	17130	17137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017163	CAAT	2	8	17503	17510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017163	AAAT	2	8	18178	18185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017163	ACCAAT	2	12	18191	18202	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017163	GTC	2	6	18205	18210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017163	ACA	2	6	18355	18360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017163	TTAA	2	8	19122	19129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017163	ATT	2	6	19212	19217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017163	ATAA	2	8	19228	19235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017163	AAT	2	6	19276	19281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017163	TTA	2	6	19290	19295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017163	TAA	2	6	19581	19586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017163	TAT	2	6	19597	19602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017163	TCAT	2	8	20330	20337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017163	ATG	2	6	20346	20351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017163	AT	3	6	20449	20454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017163	A	6	6	20482	20487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017163	TTG	3	9	21199	21207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017163	CAA	3	9	21216	21224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017163	T	8	8	21437	21444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017163	A	8	8	21454	21461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017163	CAA	2	6	21467	21472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017163	AGG	2	6	21490	21495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017163	CAA	2	6	21587	21592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017163	AATA	2	8	21603	21610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017163	TAA	2	6	21621	21626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017163	AT	3	6	21647	21652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017163	A	7	7	22054	22060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017163	AAT	2	6	22130	22135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017163	AT	3	6	22142	22147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017163	A	6	6	22204	22209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017163	GCA	2	6	22212	22217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017163	T	6	6	22229	22234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017163	ATA	2	6	22241	22246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017163	TGA	2	6	28226	28231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017163	A	6	6	28242	28247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017163	T	6	6	31283	31288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017163	A	6	6	33504	33509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017163	TTTG	2	8	33526	33533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017163	ATA	2	6	38899	38904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017163	A	6	6	41938	41943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017163	AGG	2	6	41945	41950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017163	GCT	2	6	41964	41969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017163	ATT	2	6	43571	43576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017163	TAAC	2	8	43578	43585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017163	CAAT	2	8	43588	43595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017163	T	7	7	43619	43625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017163	T	7	7	43633	43639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017163	ATTT	2	8	43656	43663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017163	T	7	7	45545	45551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017163	A	6	6	45573	45578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017163	TTAAGA	2	12	45619	45630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017163	T	6	6	45725	45730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017163	AT	3	6	45745	45750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017163	ATC	2	6	45763	45768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_017163	ATC	2	6	45863	45868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017163	TA	3	6	45894	45899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017163	TAA	3	9	45905	45913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017163	A	7	7	74405	74411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.